Theo người phát ngôn Bộ Y tế Ai Cập, tai nạn xảy ra khi hai tàu bất ngờ va chạm với nhau trong lúc di chuyển với tốc độ cao. Hiện trường vụ va chạm là đoạn đường sắt chạy qua tỉnh Sohag, cách thủ đô Cairo 460 km về phía bắc. Lực lượng cứu hộ đã kịp thời có mặt tại hiện trường.
Đoạn video clip mà hãng tin AFP của Pháp có được cho thấy tại hiện trường vụ va chạm, một số toa tàu đã bị lật.